Σε αυτό το μονοήμερο εργαστήριο, το οποίο έχει εισαγωγικό χαρακτήρα, στοχεύουμε να εξοικειώσουμε το κοινό με τις απαιτήσεις και τις προκλήσεις της γονιδιωματικής και μεταγονιδιωματικής ανάλυσης στην πλατφόρμα Galaxy.
Η διαδικτυακή διεξαγωγή αυτού του εργαστηρίου οφείλεται στους περιορισμούς λόγω COVID-19.
Τα θέματα θα περιλαμβάνουν:
- Εισαγωγή στη Μεταγονιδιωματική Ανάλυση - κύρια χαρακτηριστικά της πλατφόρμας ANASTASIA
- Εισαγωγή στην πλατφόρμα GALAXY
- Παρουσίαση των ροών εργασίας για γονιδιωματικές και μεταγονιδιωματικές αναλύσεις
- Ροές εργασίας για συναρμολόγηση και επισημείωση γονιδιωμάτων με την πλατφόρμα ANASTASIA. Χρήση αρχείων docker για ανάπτυξη ροών εργασίας σε Galaxy-Anastasia
- Λειτουργική ανάλυση και χαρακτηρισμός των γονιδιωμάτων και των μεταγονιδιωμάτων με το BioTranslator
Σχετικοί ιστοτόποι:
- https://bio.tools/ANASTASIA
- http://biotranslator.gr:8080/
- https://usegalaxy.elixir-greece.org/ (απαιτείται εγγραφή των συμμετεχόντων πριν από την ημερίδα)
Location:
Online (https://zoom.us/j/91673851943?pwd=dGRqd253Um9jZGQzb3FLNG5EUmZJZz09)
Institution:
National Hellenic Research Foundation
Category:
Basic bioinformatics courses
Scientific Software
Omics
Target Audience:
Scientists
PhD students
Undergraduate students